Boc-D-Cyclopropylalanine ถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการทางเคมีที่ต้องการควบคุมโครงสร้างและคุณสมบัติของโมเลกุลเป้าหมาย มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารประกอบทางเภสัชกรรมที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านไวรัส นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการศึกษาวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพและความจำเพาะเจาะจงมากขึ้น