Boc-D-Dap-OH ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะหน่วยย่อยสำหรับสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน กลุ่มป้องกัน Boc (tert-butoxycarbonyl) ของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกเพศในระหว่างกระบวนการจับคู่ ทำให้มีคุณค่ากในการสร้างโซ่เปปไทด์ที่มีลำดับเฉพาะเจาะจง โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในเคมียารักษาโรคสำหรับออกแบบยาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ ซึ่งการควบคุมการรวมกรดอะมิโนอย่างแม่นยำเป็นสิ่งสำคัญ นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบของเปปไทด์ กลไกเอนไซม์ และการพับตัวของโปรตีน ความเสถียรและความเข้ากันได้กับเทคนิคการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบทั้งในสถานศึกษาและอุตสาหกรรม