สารเคมีนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในฐานะอนุพันธ์อาร์จินีนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการผลิตเปปไทด์ เพื่อให้แน่ใจว่าส่วนของอาร์จินีนได้รับการป้องกันในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ กลุ่ม Boc (tert-butyloxycarbonyl) ป้องกันกลุ่มอะมิโน ในขณะที่กลุ่ม Mts (mesitylene-2-sulfonyl) ปกป้องหน้าที่กวานิดีนของอาร์จินีน การป้องกันนี้มีความสำคัญในการป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ นอกจากนี้ รูปแบบเกลือ cyclohexylamine (CHA) ยังช่วยเพิ่มความเสถียรและความละลาย ทำให้จัดการได้ง่ายในสภาพแวดล้อมห้องปฏิบัติการ สารนี้มักใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตายแข็ง (SPPS) และมีคุณค่าต่อประสิทธิภาพในการสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชกรรมและการพัฒนายา