Z-Trp-ONp ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มป้องกันสำหรับทริปโตเฟน กลุ่ม Z (benzyloxycarbonyl) ป้องกันกลุ่มอะมิโนของทริปโตเฟน ในขณะที่เอสเตอร์ ONp (p-nitrophenyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มกระตุ้นสำหรับกลุ่มคาร์บอกซิล เพื่ออำนวยความสะดวกในการสร้างพันธะเปปไทด์ สารนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะในสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งการป้องกันและกระตุ้นแบบเลือกสรรเป็นสิ่งสำคัญในการสร้างโซ่เปปไทด์ที่ซับซ้อน การนำไปใช้ช่วยให้ปฏิกิริยาคัปปลิ้งมีประสิทธิภาพและสามารถควบคุมได้ ลดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์และเพิ่มผลผลิต นอกจากนี้ Z-Trp-ONp ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษากโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์ รวมถึงการพัฒนายาที่มีฐานเป็นเปปไทด์