N5-Acetyl-N2-Fmoc-L-Ornithine เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในเทคนิคการสังเคราะห์แบบของแข็ง (Solid-phase peptide synthesis, SPPS) สารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยโครงสร้างสำคัญในการสร้างเปปไทด์ที่มีความซับซ้อน เนื่องจากกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ช่วยในการป้องกันกลุ่มอะมิโนระหว่างขั้นตอนการสังเคราะห์ ในขณะที่กลุ่มอะเซทิลทำหน้าที่ป้องกันกลุ่มอะมิโนด้านข้างของออร์นิธีน ทำให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อพัฒนายาหรือสารชีวโมเลกุลใหม่ๆ ที่มีศักยภาพในการรักษาโรค