Fmoc-Orn(ivDde)-OH ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) กลุ่ม Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับกลุ่มอะมิโน ช่วยให้สามารถกำจัดป้องกันอย่างเลือกสรรได้ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ กลุ่ม ivDde (1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-methylbutyl) เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับอะมีนของสายข้างของ ornithine ซึ่งให้ความเป็นออร์โธกอนัลต่อกลุ่ม Fmoc ความเป็นออร์โธกอนัลนี้ช่วยให้สามารถกำจัดป้องกันสายข้างอย่างเลือกสรรได้โดยไม่กระทบต่อกลุ่มอะมิโนที่ป้องกันด้วย Fmoc ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อน

สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ต้องการการดัดแปลงหรือการเชื่อมต่ออย่างเลือกสรรที่ตำแหน่งเฉพาะ เช่น ใช้ในการเตรียมยาที่มีฐานเป็นเปปไทด์, bioconjugates, และเปปไทด์ที่ติดฉลากสำหรับการวิจัยและวัตถุประสงค์วินิจฉัย กลุ่ม ivDde สามารถถูกกำจัดออกภายใต้สภาวะอ่อนโยนโดยใช้ hydrazine ซึ่งช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันหรือการเชื่อมต่อเพิ่มเติมของสายข้าง ornithine ได้ สิ่งนี้ทำให้ Fmoc-Orn(ivDde)-OH เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายในการพัฒนายาเปปไทด์, วัคซีน, และเปปไทด์ที่กระตุ้นทางชีวภาพอื่นๆ