สารนี้ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการสร้างสายเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ Fmoc-Orn(Z)-OH ทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้าง (building block) ที่สำคัญในการนำกรดอะมิโนออร์นิทีนเข้าไปในโครงสร้างเปปไทด์ กลุ่มป้องกัน Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) และ Z (Benzyloxycarbonyl) ช่วยป้องกันกลุ่มฟังก์ชันที่ไม่ต้องการให้เกิดปฏิกิริยาระหว่างขั้นตอนการสังเคราะห์ ทำให้ควบคุมกระบวนการได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพใหม่ๆ ที่มีความซับซ้อนและประสิทธิภาพสูง