Fmoc-L-Selenomethionine ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) มันทำหน้าที่เป็นรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของ selenomethionine ซึ่งช่วยให้สามารถนำเซเลเนียมเข้าไปรวมในเปปไทด์ได้ นี่เป็นสิ่งที่มีคุณค่าอย่างยิ่งในการศึกษา selenoproteins และหน้าที่ของพวกเขา เนื่องจากเซเลเนียมมีบทบาทสำคัญในกิจกรรมของเอนไซม์และการป้องกันอนุมูลอิสระ กลุ่ม Fmoc ให้การป้องกันชั่วคราวระหว่างการสังเคราะห์ เพื่อให้มั่นใจในการถอดป้องกันแบบเลือกเพศและการประกอบโซ่เปปไทด์ที่ถูกต้อง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในชีววิทยาโครงสร้างสำหรับการวิเคราะห์โครงสร้างด้วยเอ็กซ์เรย์คริสตัลโลกราฟี โดยที่เซเลเนียมทำหน้าที่เป็นตัวกระเจิงผิดปกติเพื่อช่วยในการกำหนดเฟสและการชี้แจงโครงสร้างโปรตีน การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การวิจัยทางชีวเคมี ซึ่งช่วยให้สามารถสำรวจบทบาทของเซเลเนียมในการควบคุม redox และเส้นทางสัญญาณเซลล์