N-Fmoc-7-methyl-L-tryptophan ถูกใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ช่วยในการรวมส่วนของ tryptophan เข้าสู่เปปไทด์โดยป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับกลุ่มอะมิโน ซึ่งสามารถกำจัดได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อน กลุ่มเมทิลบนวงแหวน indole ของ tryptophan ช่วยเพิ่มความเสถียรและสามารถมีอิทธิพลต่อกิจกรรมทางชีวภาพหรือคุณสมบัติโครงสร้างของเปปไทด์ สารประกอบนี้มีคุณค่าต่อการพัฒนาเปปไทด์บำบัด เปปไทด์สำหรับการวิจัย และในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างโปรตีน