สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสร้างลำดับเปปไทด์ที่ซับซ้อน โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งกลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับส่วนอะมิโน ช่วยให้สามารถประกอบเปปไทด์ได้อย่างควบคุมและทีละขั้นตอน โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) การมีกลุ่ม hydroxyl บนวงแหวน phenyl ทำให้เหมาะสำหรับการนำโครงสร้างคล้าย tyrosine เข้าสู่เปปไทด์ ซึ่งมีความสำคัญสำหรับการออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ ซับสเตรตของเอนไซม์ หรือตัวยับยั้ง นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนายาและการวิจัยทางชีวเคมี ที่ต้องการลำดับเปปไทด์ที่แม่นยำสำหรับการศึกษาการโต้ตอบของโปรตีน เส้นทางส่งสัญญาณ หรือการค้นพบยา ความเสถียรและความเข้ากันได้กับโปรโตคอลการสังเคราะห์เปปไทด์มาตรฐานทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการเคมีอินทรีย์และเคมียา