สารเคมีนี้ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีลำดับเฉพาะ โดยเฉพาะเมื่อต้องการรวมกลุ่ม cyclopropyl ในโครงสร้าง กลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นส่วนป้องกันสำหรับกลุ่มอะมิโน เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรได้ในระหว่างการประกอบสายเปปไทด์ ส่วนข้าง cyclopropyl ของมันช่วยเพิ่มความแข็งของโครงสร้างเชิง conformational ในเปปไทด์ที่ได้ ซึ่งอาจสำคัญสำหรับการศึกษา interaction ของโปรตีนหรือการออกแบบสารประกอบชีวภาพที่ใช้งานได้ มักนำมาใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) สำหรับการพัฒนายา เปปไทด์เพื่อการวิจัย และ bioconjugates