Fmoc-D-Ser(trt)-OH เป็นสารประกอบที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการสังเคราะห์เปปไทด์แบบของแข็ง (Solid-phase peptide synthesis, SPPS) สารนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยกลุ่ม Fmoc (9-ฟลูออเรนิลเมท็อกซิคาร์บอนิล) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่เอมีน และกลุ่ม trityl (trt) ป้องกันหมู่ไฮดรอกซิลของส่วนข้างเซรีน การป้องกันแบบคู่นี้ช่วยให้สามารถกำจัดกลุ่มป้องกันของหมู่เอมีนได้อย่างเลือกสรรระหว่างการยืดสายโซ่เปปไทด์ ทำให้เกิดการสังเคราะห์ที่แม่นยำและควบคุมได้ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน โดยที่การรักษาความสมบูรณ์ของส่วนข้างเซรีนเป็นสิ่งสำคัญ นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนายา เปปไทด์ชีวภาพ และเครื่องมือวิจัยสำหรับศึกษากโครงสร้างและการทำงานของโปรตีน ความเข้ากันได้กับเครื่องสังเคราะห์เปปไทด์อัตโนมัติทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในทั้งสถานศึกษาและอุตสาหกรรม