Fmoc-Cys(Mtt)-OH เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการปกป้องกลุ่มไทออลของซีสเตอีน (Cysteine) ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ สารนี้มีประโยชน์ในการป้องกันไม่ให้กลุ่มไทออลทำปฏิกิริยากับสารอื่นๆ ที่ไม่ต้องการในระหว่างการสร้างเปปไทด์ ซึ่งช่วยให้สามารถควบคุมและออกแบบโครงสร้างเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน หรือเปปไทด์ที่ต้องการการปกป้องกลุ่มไทออลเฉพาะที่ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โปรตีนหรือเปปไทด์ที่ใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยาและยา