()-S-Trityl-L-cysteine ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับหน้าที่ไทออลของซิสเทอีน กลุ่มไตรทิลช่วยปกป้องกลุ่มไทออลจากปฏิกิริยาที่ไม่พึงประสงค์ระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้มั่นใจในความสมบูรณ์ของสายเปปไทด์ เมื่อการสังเคราะห์เสร็จสิ้น กลุ่มไตรทิลสามารถถูกกำจัดออกอย่างเลือกเฉพาะภายใต้สภาวะกรดอ่อน เผยให้เห็นกลุ่มไทออลอิสระสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติมหรือสำหรับการก่อตัวพันธะไดซัลไฟด์ ซึ่งมีความสำคัญต่อความมั่นคงของโครงสร้างในโปรตีนและเปปไทด์หลายชนิด นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และการพับตัวของโปรตีน โดยที่การป้องกันและการยกเลิกป้องกันของสารตกค้างซิสเทอีนมีความจำเป็นสำหรับการทำความเข้าใจบทบาทของมันในกระบวนการทางชีวภาพ