โปรติเอสเป็นเอนไซม์ที่มีบทบาทสำคัญในการย่อยสลายโปรตีนเป็นเปปไทด์หรือกรดอะมิโนขนาดเล็กลง ทำให้ถูกนำไปใช้ในหลากหลายอุตสาหกรรม โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมซักผ้า เนื่องจากสามารถช่วยย่อยคราบโปรตีน เช่น คราบเลือด ไข่ หรือเหงื่อ ทำให้ผงซักฟอกมีประสิทธิภาพสูงขึ้นแม้ที่อุณหภูมิต่ำ ในอุตสาหกรรมอาหาร โปรติเอสใช้ในการปรับปรุงเนื้อสัมผัสของอาหาร เช่น การทำให้เนื้อสัตว์นุ่มขึ้น หรือใช้ในกระบวนการผลิตชีส ถั่วเหลืองหมัก และน้ำปลา นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมหนังเพื่อช่วยกำจัดเส้นขนและโปรตีนส่วนเกินออกจากร่างหนังก่อนฟอกหนัง ในทางการแพทย์ โปรติเอสถูกใช้ในผลิตภัณฑ์ยาหรือครีมบางชนิดเพื่อช่วยย่อยเซลล์ผิวที่ตายแล้ว หรือใช้รักษาแผลโดยช่วยกำจัดเนื้อเยื่อที่เสียหาย ในอุตสาหกรรมชีวภาพ โปรติเอสยังใช้ในการแยกหรือตัดโปรตีนเป้าหมายในกระบวนการวิจัยและผลิตโปรตีนบริสุทธิ์ โดยรวม โปรติเอสเป็นเอนไซม์ที่มีความสำคัญสูงในหลายสาขา เนื่องจากความสามารถในการย่อยโปรตีนอย่างมีประสิทธิภาพและเฉพาะเจาะจง