โปรติเอสเป็นเอนไซม์ที่ช่วยย่อยโปรตีนให้สลายตัวเป็นเปปไทด์หรือกรดอะมิโนขนาดเล็กลง ทำให้มีการนำไปใช้ในหลายอุตสาหกรรม เช่น ในอุตสาหกรรมซักผ้า โปรติเอสถูกใช้ในผงซักฟอกและน้ำยาซักผ้า เพื่อช่วยย่อยคราบโปรตีนจากเลือด ไข่ หรือเหงื่อ ทำให้คราบหลุดออกได้ง่าย โดยเฉพาะในน้ำเย็นที่สารเคมีอื่นอาจทำงานได้ไม่ดี ในอุตสาหกรรมอาหาร โปรติเอสถูกใช้ในการทำน้ำปลา เต้าเจี้ยว หรือซอสต่างๆ เพื่อช่วยเร่งกระบวนการหมักและย่อยโปรตีนจากถั่วเหลืองหรือปลาให้ได้รสชาติกลมกล่อมเร็วขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในผลิตภัณฑ์นม เช่น การผลิตชีส เพื่อช่วยให้โปรตีนในนมจับตัวกันและแยกตัวออกจากกันได้ดี ในอุตสาหกรรมเครื่องสำอาง โปรติเอสถูกใช้ในผลิตภัณฑ์ขัดผิวหรือมาสก์หน้า เพื่อช่วยขจัดเซลล์ผิวที่ตายแล้วอย่างอ่อนโยน โดยย่อยโปรตีนในชั้นผิวบนสุด ในอุตสาหกรรมเกษตร โปรติเอสถูกใช้ในการย่อยเศษซากพืชหรือสัตว์เพื่อผลิตปุ๋ยอินทรีย์ หรือใช้ในอาหารสัตว์เพื่อช่วยให้สัตว์ย่อยโปรตีนได้ดีขึ้น นอกจากนี้ยังมีการใช้ในทางการแพทย์ เช่น ใช้ล้างแผลหรือกำจัดเนื้อเยื่อที่ตายแล้วในแผลไฟไหม้หรือแผลเรื้อรัง โปรติเอสจึงเป็นเอนไซม์ที่มีความสำคัญและถูกประยุกต์ใช้ในชีวิตประจำวันและอุตสาหกรรมต่างๆ อย่างกว้างขวาง