Nα-Benzoyl-DL-arginine β-naphthylamide hydrochloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการศึกษากิจกรรมของเอนไซม์โปรตีเอส (protease) ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการย่อยโปรตีน เนื่องจากสารนี้เป็นสารตั้งต้นที่ใช้ในการทดสอบกิจกรรมของเอนไซม์ทริปซิน (trypsin) และเอนไซม์อื่นๆ ในตระกูลเซรีนโปรตีเอส (serine protease)

นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาวิธีการตรวจวัดทางเคมีและชีวภาพ เพื่อประเมินประสิทธิภาพของสารยับยั้งเอนไซม์ (enzyme inhibitors) ที่อาจมีศักยภาพในการรักษาโรคต่างๆ เช่น โรคมะเร็งหรือโรคติดเชื้อ การใช้สารนี้ช่วยให้นักวิจัยสามารถวิเคราะห์กลไกการทำงานของเอนไซม์และออกแบบยาที่มีประสิทธิภาพมากขึ้นได้