ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในขั้นตอนที่ต้องการป้องกันหมู่ข้างของกรดกลูตามิก เพื่อป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาข้างเคียงระหว่างการสร้างเปปไทด์ หมู่ Fmoc ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันปลายอะมิโน ซึ่งสามารถถอดออกได้ง่ายด้วยสารละลายเบสอ่อน เช่น แพนิทรีน ในขณะที่หมู่พาราไนโตรานิลไลด์ (pNA) ทำหน้าที่เป็นตัวบ่งชี้ในการติดตามปฏิกิริยา เพราะมีสีเหลืองและสามารถตรวจวัดได้ด้วยการดูดกลืนแสงที่ความยาวคลื่น 380 นาโนเมตร ทำให้เหมาะสำหรับการตรวจสอบประสิทธิภาพของการเชื่อมต่อเปปไทด์แบบเรียลไทม์ในห้องปฏิบัติการ