FMK ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านชีววิทยาโมเลกุลและเภสัชวิทยา เนื่องจากมีความสามารถในการยับยั้งเอนไซม์ protease โดยเฉพาะ caspase ซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการ apoptosis (การตายของเซลล์ตามโปรแกรม) FMK มักใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษากลไกการตายของเซลล์และบทบาทของ caspase ในการเกิดโรคต่างๆ เช่น มะเร็งและโรคทางระบบประสาท นอกจากนี้ FMK ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาที่เกี่ยวข้องกับการควบคุม apoptosis ในทางคลินิกอีกด้วย