Z-YVAD-FMK ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะตัวยับยั้งเฉพาะเจาะจงของเอนไซม์ caspase-1 ซึ่งมีบทบาทในกระบวนการอักเสบและการตายของเซลล์แบบโปรแกรม (apoptosis) สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการศึกษาที่มุ่งเข้าใจบทบาทของ caspase-1 ในเส้นทางเซลล์ต่าง ๆ รวมถึงการสุกของไซโตไคน์ที่ก่อให้เกิดการอักเสบ เช่น interleukin-1β นักวิจัยใช้ Z-YVAD-FMK เพื่อยับยั้งกิจกรรมของ caspase-1 ช่วยให้สามารถตรวจสอบผลกระทบต่อการตอบสนองการอักเสบและกลไกการตายของเซลล์ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในโมเดลทดลองของโรคที่ caspase-1 มีบทบาทสำคัญ เช่น sepsis, โรคเสื่อมถอยของระบบประสาท และภาวะภูมิต้านตนเอง โดยการยับยั้ง caspase-1 Z-YVAD-FMK ช่วยให้สามารถชี้แจงเป้าหมายการรักษาที่เป็นไปได้สำหรับโรคที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบ