สาร Caspase-9 Inhibitor III (Ac-LEHD-CMK) มีการใช้งานหลักในการศึกษาวิจัยทางชีววิทยาและทางการแพทย์ โดยเฉพาะในด้านการวิจัยเกี่ยวกับกระบวนการอะพอพโทซิส (apoptosis) ซึ่งเป็นกระบวนการตายของเซลล์ตามธรรมชาติ สารนี้ช่วยยับยั้งการทำงานของเอนไซม์ caspase-9 ซึ่งมีบทบาทสำคัญในเส้นทางการตายของเซลล์ผ่านทาง mitochondria จึงถูกใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษากลไกการควบคุมการตายของเซลล์และความเกี่ยวข้องกับโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคทางระบบประสาท และโรคที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบ นอกจากนี้ ยังมีการนำสารนี้ไปใช้ในการทดสอบประสิทธิภาพของยาหรือสารประกอบใหม่ๆ ที่มีเป้าหมายในการยับยั้งกระบวนการอะพอพโทซิส เพื่อพัฒนาการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการตายของเซลล์ที่ผิดปกติ