E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 58 ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาการย่อยสลายโปรตีนแบบกำหนดเป้าหมาย ซึ่งเป็นแนวทางล้ำสมัยในการค้นพบยาและพัฒนาการบำบัด สารคอนจูเกตเหล่านี้ถูกออกแบบมาเพื่อดึงดูด E3 ubiquitin ligases ไปยังโปรตีนเป้าหมายเฉพาะ โดยทำเครื่องหมายให้โปรตีนเหล่านั้นถูกย่อยสลายโดย proteasome กระบวนการนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการแก้ไขโรคที่เกิดจากการแสดงออกเกินหรือการทำงานผิดปกติของโปรตีนบางชนิด เช่น มะเร็ง โรคเสื่อมถอยของระบบประสาท และการติดเชื้อไวรัส

ในการวิจัย สารคอนจูเกตเหล่านี้ถูกนำมาใช้เพื่อศึกษาฟังก์ชันของโปรตีนและตรวจสอบเป้าหมายยาที่มีศักยภาพโดยการย่อยสลายโปรตีนที่สนใจอย่างเลือกสรร พวกมันยังเป็นส่วนสำคัญในการพัฒนา PROTACs (Proteolysis Targeting Chimeras) ซึ่งเป็นกลุ่มโมเลกุล bifunctional ชนิดใหม่ที่ใช้เครื่องจักรย่อยสลายตามธรรมชาติของเซลล์เพื่อกำจัดโปรตีนที่ก่อให้เกิดโรค เทคโนโลยีนี้มีข้อดีเหนือกว่ายับยั้งแบบดั้งเดิม เนื่องจากสามารถกำหนดเป้าหมายโปรตีนที่เคยถูกมองว่า "undruggable" และให้ผลกระทบที่ยั่งยืนด้วยปริมาณที่ต่ำกว่า

นอกจากนี้ E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 58 ยังถูกใช้ในชีววิทยาเคมีเพื่อสำรวจพลวัตของระบบ ubiquitin-proteasome และพัฒนา degraders ที่มีประสิทธิภาพและเลือกสรรได้ดีขึ้น การประยุกต์ใช้ของพวกมันยังคงขยายตัวเมื่อนักวิจัยค้นพบโอกาสบำบัดใหม่ๆ ในยาวิศวกรรมเฉพาะบุคคล