E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 40 ถูกนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับระบบ ubiquitin-proteasome pathway ซึ่งเป็นกระบวนการสำคัญในการควบคุมระดับโปรตีนภายในเซลล์ โดยสารนี้ช่วยในการออกแบบและสร้างโมเลกุลที่สามารถกำหนดเป้าหมายโปรตีนเฉพาะเพื่อทำลายหรือปรับเปลี่ยนหน้าที่ของมัน การประยุกต์ใช้หลักอยู่ในสาขา Targeted Protein Degradation (TPD) ซึ่งเป็นแนวทางใหม่ในการรักษาโรค เช่น มะเร็ง โดยการใช้สารนี้เพื่อสร้าง PROTACs (Proteolysis Targeting Chimeras) ซึ่งเป็นโมเลกุลที่สามารถจับกับโปรตีนเป้าหมายและ E3 ubiquitin ligase เพื่อส่งสัญญาณให้เซลล์ทำลายโปรตีนนั้น นอกจากนี้ ยังมีการใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยาเพื่อศึกษาหน้าที่ของโปรตีนและกลไกการควบคุมภายในเซลล์ ซึ่งช่วยให้นักวิทยาศาสตร์เข้าใจโรคและพัฒนาวิธีการรักษาที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น