E3ligaseLigand-LinkerConjugates33Hydrochloride ถูกใช้หลักๆ ในสาขาการสลายโปรตีนแบบกำหนดเป้าหมาย (targeted protein degradation) ซึ่งเป็นแนวทางล้ำสมัยในการค้นคว้าและพัฒนายา สารประกอบนี้ถูกออกแบบมาเพื่ออำนวยความสะดวกในการสลายโปรตีนเฉพาะเจาะจงโดยการใช้ระบบ ubiquitin-proteasome มันทำงานโดยการจับกับโปรตีนเป้าหมายและดึงดูด E3 ubiquitin ligase ซึ่งจะติดแท็กโปรตีนนั้นเพื่อการสลายโดย proteasome กลไกนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการแก้ไขโรคที่เกิดจากการแสดงออกเกินหรือการทำงานผิดปกติของโปรตีนเฉพาะ เช่น มะเร็งบางชนิด โรคเสื่อมถอยของระบบประสาท และภาวะภูมิคุ้มกันผิดปกติ การประยุกต์ใช้นั้นขยายไปถึงการพัฒนา PROTACs (Proteolysis Targeting Chimeras) ซึ่งเป็นกลุ่มตัวแทนบำบัดแบบใหม่ที่ให้ข้อได้เปรียบเหนือยับยั้งโมเลกุลเล็กแบบดั้งเดิม โดยช่วยให้สามารถกำจัดโปรตีนก่อโรคได้อย่างสมบูรณ์แทนที่จะเพียงยับยั้งกิจกรรม ส่วนประกอบลิงเกอร์ของสารประกอบนี้ช่วยให้มั่นใจในตำแหน่งเชิงพื้นที่ที่เหมาะสมและความเสถียร เพิ่มประสิทธิภาพในระบบชีวภาพ