3-Methoxy PGF1α ใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษาบทบาททางสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาของสารพรอสตาแกลนดิน โดยทำหน้าที่เป็นอนุภาคจำลองที่เสถียรของ prostaglandin F1α ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถตรวจสอบผลกระทบต่อการหดตัวของกล้ามเนื้อเรียบ การอักเสบ และกระบวนการสืบพันธุ์ ในงานวิจัยทางการแพทย์ ถูกนำมาใช้เพื่อสำรวจการประยุกต์ใช้ทางอุบัติเหตุที่เป็นไปได้ในภาวะเช่น ความดันโลหิตสูง หอบหืด และความผิดปกติด้านการเจริญพันธุ์ นอกจากนี้ยังช่วยในการทำความเข้าใจเส้นทางชีวเคมีและการโต้ตอบของตัวรับของสารพรอสตาแกลนดิน สนับสนุนการพัฒนาการรักษาที่มุ่งเป้าเฉพาะ