โพแทสเซียม ฟีนิลไตรฟลูออโรโบเรต ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารเคมีที่เสถียรและหลากหลายในปฏิกิริยาครอส-คัพพลิง โดยเฉพาะปฏิกิริยาซูซูกิ-มิยาอูระ ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าต่อการผลิตยา สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง ความเสถียรต่ออากาศและความชื้นช่วยให้จัดการและเก็บรักษาได้ง่ายกว่าเมื่อเทียบกับสารเคมีโบรอนอื่นๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติและโพลิเมอร์ เนื่องจากความเข้ากันได้กับกลุ่มฟังก์ชันต่างๆ และสภาวะปฏิกิริยาที่อ่อนโยน