สารประกอบนี้มีการใช้งานหลักในด้านการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิง ซึ่งทำหน้าที่เป็นรีเอเจนต์ออร์กาโนบอรอนที่เสถียรและมีประสิทธิภาพ กลุ่มไตรฟลูออโรบอเรตช่วยเพิ่มความเสถียรและความสะดวกในการจัดการ ทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาเช่นซูซูกิ-มิยาอูระ ซึ่งใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร การมีกลุ่มคลอโรฟีนิลช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติม สร้างโครงสร้างเคมีที่หลากหลาย นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการพัฒนาวัสดุขั้นสูงและในเคมีทางการแพทย์สำหรับการค้นพบและพัฒนายา