ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการนำกลุ่ม cyclopropylamine เข้าสู่โมเลกุลเป้าหมาย ความคงทนและปฏิกิริยาของมันทำให้มีประโยชน์อย่างยิ่งในปฏิกิริยา cross-coupling เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโครงสร้างอินทรีย์ที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในเคมียารักษาเพื่อพัฒนายา โดยกลุ่ม cyclopropyl สามารถเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความคงตัวทางเมแทบอลิซึมของผู้สมัครยา ส่วนของ trifluoroborate ยังมีส่วนช่วยในเทคนิค bioconjugation และ labeling