E-4031 ใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษากายวิภาคไฟฟ้าหัวใจ (cardiac electrophysiology) เนื่องจากมีฤทธิ์เฉพาะตัวในการยับยั้งช่องโพแทสเซียม hERG อย่างแรง ช่องทางนี้มีบทบาทสำคัญในระยะการคืนตัว (repolarization) ของศักย์ไฟฟ้าการกระตุกของหัวใจ และ E-4031 มักใช้ในการสืบสวนอาการหัวใจเต้นผิดจังหวะ (arrhythmias) และกลไกที่อยู่เบื้องหลังกลุ่มอาการ QT ยาว (long QT syndrome) การยับยั้ง hERG ช่วยให้นักวิจัยเข้าใจผลกระทบของการคืนตัวล่าช้าต่อการทำงานของหัวใจ และประเมินความเป็นพิษต่อหัวใจ (cardiotoxicity) ที่อาจเกิดจากยาใหม่ นอกจากนี้ ยังใช้เป็นเครื่องมือในงานวิจัยก่อนคลินิกเพื่อประเมินโปรไฟล์ความปลอดภัยของสารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะยาที่อาจรบกวนช่อง hERG โดยไม่ได้ตั้งใจ