IWP-3 ใช้หลักในการวิจัยเพื่อศึกษเส้นทางการส่งสัญญาณ Wnt ซึ่งมีบทบาทสำคัญในกระบวนการเซลล์ เช่น การพัฒนา การเพิ่มจำนวน และการแยกตัว โดยยับยั้ง Porcupine ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่จำเป็นสำหรับการหลั่งโปรตีน Wnt IWP-3 ช่วยให้นักวิจัยตรวจสอบผลกระทบของการรบกวนการส่งสัญญาณ Wnt ในระบบชีววิทยาต่างๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการวิจัยเซลล์ต้นกำเนิด โดยช่วยทำความเข้าใจว่าการส่งสัญญาณ Wnt มีอิทธิพลต่อการบำรุงรักษาและการแยกตัวของเซลล์ต้นกำเนิดอย่างไร นอกจากนี้ IWP-3 ยังใช้ในการวิจัยมะเร็งเพื่อสำรวจบทบาทของการส่งสัญญาณ Wnt ในการเจริญเติบโตและการลุกลามของเนื้องอก ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับเป้าหมายการรักษาที่เป็นไปได้ การประยุกต์ใช้ขยายไปยังชีววิทยาการพัฒนา ซึ่งช่วยชี้แจงกลไกของการก่อตัวเนื้อเยื่อและการเกิดอวัยวะ