เพปโตนถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในห้องปฏิบัติการทางจุลชีววิทยาและเทคโนโลยีชีวภาพ เนื่องจากเป็นแหล่งอาหารที่อุดมไปด้วยไนโตรเจนและสารอาหารอื่นๆ ที่จำเป็นสำหรับการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ มักใช้เป็นส่วนประกอบในอาหารเลี้ยงเชื้อสำหรับการเพาะเลี้ยงแบคทีเรีย ยีสต์ และเชื้อรา นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตวัคซีน เอนไซม์ และผลิตภัณฑ์ทางชีวภาพอื่นๆ ในอุตสาหกรรม เพปโตนยังมีบทบาทสำคัญในการศึกษาด้านชีวเคมีและเซลล์วิทยา โดยใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์โปรตีนและกรดอะมิโน รวมถึงการทดสอบทางชีวภาพต่างๆ เช่น การทดสอบการเจริญเติบโตของเซลล์และการวิเคราะห์กิจกรรมของเอนไซม์ ในอุตสาหกรรมอาหาร เพปโตนอาจใช้เป็นส่วนผสมในการผลิตอาหารเสริมหรือสารให้รสชาติ เพื่อเพิ่มคุณค่าทางโภชนาการและปรับปรุงคุณภาพของผลิตภัณฑ์