(S)-Methyl piperidine-3-carboxylate ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพต่าง ๆ มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง รวมถึงยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต โครงสร้าง chiral ของมันทำให้มีคุณค่าต่อการผลิตสารที่บริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ ซึ่งจำเป็นสำหรับการรับประกันประสิทธิภาพและความปลอดภัยของยา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการเตรียมอัลคาลอยด์และฮีเทอโรไซเคิลที่มีไนโตรเจน อีกทั้งความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการวิจัยเคมีเกษตร ที่ซึ่งช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ ๆ