4-(4-Methoxyphenoxy)piperidine ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาใหม่ๆ ที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง สารนี้มักถูกใช้เป็น intermediate ในการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางจิตเวช เช่น โรคซึมเศร้าและโรควิตกกังวล นอกจากนี้ยังมีการศึกษาถึงการนำไปใช้ในสารต้านการอักเสบและสารต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงได้