2-Cyclopropylpiperidine hydrochloride ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารยาใหม่ โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่ม cyclopropyl ติดกับวงแหวน piperidine ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษา สารนี้มักถูกสำรวจในการออกแบบยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) เนื่องจากส่วน piperidine พบได้บ่อยในสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังตัวรับทางระบบประสาท นอกจากนี้ ยังอาจใช้ในการศึกษายับยั้งเอนไซม์หรือเป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพในเคมียารักษา รูปแบบ hydrochloride ช่วยเพิ่มความละลายน้ำ ทำให้ใช้งานง่ายในกระบวนการทดลองและการปรุงแต่งต่างๆ