1-Phenylpiperidin-3-amine ถูกนำมาใช้หลัก ๆ ในสาขาเคมีเภสัชกรรม เพื่อเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมต่าง ๆ โครงสร้างของมันมักถูกนำเข้าไปในโมเลกุลที่ออกแบบมาเพื่อโต้ตอบกับเป้าหมายในระบบประสาทส่วนกลาง ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายารักษาโรคทางระบบประสาทและจิตเวช เช่น ถูกสำรวจใช้ในการสร้างยาต้านโรคจิตและยาต้านอาการซึมเศร้า เนื่องจากความสามารถในการปรับระบบสารสื่อประสาท นอกจากนี้ สารนี้ยังถูกศึกษาสำหรับบทบาทในการออกแบบลิแกนด์สำหรับตัวรับโดพามีนและเซโรโทนิน ซึ่งสำคัญต่อการควบคุมอารมณ์ การรับรู้ และพฤติกรรม ความยืดหยุ่นในการดัดแปลงทางเคมียังช่วยให้นักวิจัยปรับแต่งคุณสมบัติทางเภสัชวิทยาของสารอนุพันธ์ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะในการนำไปใช้รักษาโรค