1-Benzyl-4-methylpiperidin-3-one ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่าง ๆ โดยเฉพาะยาที่กำหนดเป้าหมายโรคทางระบบประสาท โครงสร้างของมันถูกนำมาใช้ในการพัฒนายารักษาที่มีศักยภาพ เนื่องจากวงแหวนไพเพอริดีน ซึ่งเป็นโครงสร้างที่พบบ่อยในโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบของตัวรับและการยับยั้งเอนไซม์ ซึ่งช่วยในการค้นพบยาใหม่ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยมีส่วนในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีคุณสมบัติกำจัดศัตรูพืชหรือวัชพืช