ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเป็นเพปไทด์หรือสารที่มีไนโตรเจนเป็นองค์ประกอบหลัก โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้น (building block) ในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาที่ต้องการโครงสร้างแบบไซคลิกหรือสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างที่มีหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยป้องกันไนโตรเจนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ ทำให้สามารถควบคุมการสังเคราะห์ได้อย่างแม่นยำ และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายในขั้นตอนต่อมา