ใช้ในงานสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ต้องการหมู่ไฮไดรซีนเป็นตัวทำปฏิกิริยา โดยเฉพาะในการสร้างสารที่มีโครงสร้างพิเพอริดีน ซึ่งมักพบในสารประกอบเชิงเภสัชกรรม นิยมใช้เป็นตัวตั้งต้นในการพัฒนายาที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพ หรือสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารตัวกลางที่มีความซับซ้อน โดยหมู่ไฮไดรซีนสามารถทำปฏิกิริยากับคาร์บอนอิลได้ ทำให้เกิดไฮไดรซอน ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในหลายกลุ่มสารออกฤทธิ์