ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา เป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการสร้างโครงสร้างเพปไทด์และสารที่มีโครงสร้างพิเพอริโดน ซึ่งมักพบในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นิยมใช้ในขั้นตอนการสังเคราะห์แบบป้องกันหมู่ฟังก์ชัน (protecting group strategy) เนื่องจากหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) สามารถป้องกันหมู่อะมิโนได้อย่างมีประสิทธิภาพ และถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้ควบคุมปฏิกิริยาเคมีได้แม่นยำ เหมาะสำหรับการสร้างสารต้นแบบ (lead compound) ในการค้นคว้าวิจัยยาใหม่