ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นหรือสารตัวกลางในการสร้างโครงสร้างของยาที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่เกี่ยวข้องกับตัวรับสารสื่อประสาท เช่น ตัวรับโดพามีนหรือเซโรโทนิน โครงสร้างพิเพอริดีนที่มีหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) ช่วยป้องกันไนโตรเจนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนกลาง ทำให้สามารถควบคุมการสังเคราะห์ได้อย่างมีนัยสำคัญ และใช้ในงานวิจัยด้านเคมีทางการแพทย์เพื่อพัฒนายาใหม่ที่มีความจำเพาะและประสิทธิภาพสูง