ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นหรือสารตัวกลางในการสร้างสารที่มีโครงสร้างพิเพอริดีน ซึ่งมักพบในยาหลายชนิด โดยเฉพาะยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า ยาแก้ปวด หรือยาต้านอาการทางจิต หมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมีนในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ และสามารถกำจัดออกได้ภายหลังเมื่อต้องการให้หมู่อะมีนทำปฏิกิริยาต่อไป หมู่ไซยาโนเมทิลสามารถเปลี่ยนแปลงเป็นหมู่คาร์บอกซิล หรือหมู่อะมิโนอื่นๆ ได้ ทำให้สารนี้มีความยืดหยุ่นสูงในการออกแบบสารใหม่