ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างโครงสร้างของสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็ง หรือยาแก้อักเสบ เนื่องจากมีหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) ซึ่งทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะจุดในโมเลกุลได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้โครงสร้างพิเพอริโดนที่มีหมู่คาร์บอนิลและหมู่อัลคิลแทนที่ยังช่วยเพิ่มความเสถียรและความสามารถในการละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ ทำให้เหมาะสำหรับการใช้ในขั้นตอนการสังเคราะห์แบบหลายขั้นตอน