ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบทางเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันไฮดราซิดและอะมีนที่ได้รับการป้องกัน ใช้กันทั่วไปในเคมีทางการแพทย์เพื่อสร้างเพปไทโดมิมิติกส์และระบบเฮเทอโรไซคลิก โครงสร้างพิเปอร์ิดีนที่ป้องกันด้วย Boc ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์ยาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลางและตัวยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีแบบรวมเพื่อสร้างห้องสมุดสารประกอบ