ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการการป้องกันหมู่ฟังก์ชัน หมู่เอมีนที่ได้รับการป้องกันด้วย Boc ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันได้อย่างควบคุมภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์แบบหลายขั้นตอน โดยเฉพาะในเคมีเพปไทด์และการผลิตฮีเทอโรไซเคิลที่มีไนโตรเจน โครงสร้างหลัก piperidine พบได้บ่อยในโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ รวมถึงยาที่เล็งเป้าไปที่ระบบประสาทส่วนกลาง ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาโรคสำหรับฐานประกอบในโปรแกรมค้นพบยา