ใช้ในงานสังเคราะห์สารอินทรีย์เป็นตัวกลางสำคัญในการสร้างโครงสร้างพิเพอริดีนที่มีหมู่อัลลิลและอัลลิลออกซี ซึ่งมีความสำคัญในกระบวนการพัฒนายา โดยเฉพาะในสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลชีพ หรือสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อนในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม เนื่องจากหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยป้องกันไนโตรเจนในพิเพอริดีนได้อย่างมีประสิทธิภาพ และสามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสมกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนหลายชั้น