สารนี้มีการใช้งานหลักในด้านเคมียาและการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท โครงสร้างของสารนี้มักถูกนำเข้าไปในสารประกอบที่ออกแบบมาเพื่อโต้ตอบกับตัวรับเฉพาะในสมอง ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาการรักษาที่มีศักยภาพสำหรับภาวะเช่น โรคจิตเภท ภาวะซึมเศร้า และความวิตกกังวล นอกจากนี้ อะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของยาที่ได้ สนับสนุนประสิทธิภาพในการบำบัด นักวิจัยยังสำรวจการใช้ในการสร้างยาแก้ปวดใหม่และยาต้านการอักเสบเนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์