4-Fluoro-4-methylpiperidine hydrochloride ใช้หลัก ๆ ในงานวิจัยและพัฒนายาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่าง ๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท เช่น ยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนายาใหม่ ๆ สำหรับการจัดการความเจ็บปวดและการอักเสบ หมู่ฟลูออรีนและไพเพอรีดีนช่วยเสริมคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ของโมเลกุลที่ได้ ทำให้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานที่สำคัญในเคมียารักษาโรค