ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) เป็นหน่วยย่อยสำหรับนำหมู่ piperidine เข้าสู่โซ่เปปไทด์ กลุ่ม Fmoc ให้การป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างการสังเคราะห์ ช่วยให้สามารถกำจัดป้องกันแบบเลือกสรรและทำปฏิกิริยาคูปลิงต่อไปได้ นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนา peptidomimetics และสารประกอบชีวภาพที่ใช้งานได้ โดยโครงสร้าง piperidine มีบทบาทในการเสริมคุณสมบัติทางเภสัชวิทยา ยิ่งไปกว่านั้น ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ซับซ้อนสำหรับการค้นพบยาและการวิจัยเคมียารักษา