3-Amino-2-piperidone ถูกใช้หลักในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพและยาต่างๆ มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาสารประกอบเฮเทโรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในการสร้างยาที่กำหนดเป้าหมายโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์และความบกพร่องทางความรู้ความเข้าใจอื่นๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตตัวยับยั้งเอนไซม์ เช่น acetylcholinesterase ซึ่งสำคัญในการรักษาโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท คุณสมบัติโครงสร้างของมันยังมีคุณค่าในการออกแบบตัวยารักษาใหม่สำหรับมะเร็งและโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อสำรวจสารประกอบเคมีใหม่ที่มีกิจกรรมทางเภสัชวิทยา