กรด 1-(2,2,2-ไตรฟลูออโรอะเซทิล)ไพเพอริดีน-4-คาร์บอกซิลิก ถูกนำไปใช้หลัก ๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาหลากหลาย โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่มไตรฟลูออโรอะเซทิลและหมู่คาร์บอกซิล ทำให้มีคุณค่าต่อการปรับเปลี่ยนและเสริมคุณสมบัติของยาร่วมที่กำลังพัฒนา

สารเคมีนี้มักถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์ไพเพอริดีน ซึ่งพบได้บ่อยในยาที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาแก้ประสาทหลอนและยาแก้ปวด นอกจากนี้ กลุ่มไตรฟลูออโรอะเซทิลของมันยังสามารถทำหน้าที่เป็นกลุ่มปกป้องในการสังเคราะห์เปปไทด์ ทำให้สามารถปรับเปลี่ยนกรดอะมิโนอย่างเลือกสรรในระหว่างการผลิตเปปไทด์ที่ซับซ้อน

ในเคมีทางยา มันถูกนำไปใช้ในการสร้างโมเลกุลที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพที่ดีขึ้น เนื่องจากกลุ่มไตรฟลูออโรอะเซทิลสามารถมีอิทธิพลต่อคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ของสารประกอบที่ได้ นักวิจัยยังใช้ประโยชน์จากปฏิกิริยาของมันในการพัฒนายับยั้งใหม่สำหรับเอนไซม์หรือตัวรับ ซึ่งมีส่วนช่วยในการค้นพบตัวแทนบำบัดใหม่